Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr55Q3UJF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr55Q3UJF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms