Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp19Q3UJD6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp19Q3UJD6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp19Q3UJD6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms