Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dtx3lQ3UIR3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dtx3lQ3UIR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms