Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Tnrc6cQ3UHC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Tnrc6cQ3UHC0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Tnrc6cQ3UHC0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tnrc6cQ3UHC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,2 ms