Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Eif3j1Q3UGC7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eif3j1Q3UGC7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3j1Q3UGC7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms