Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rsph3aQ3UFY4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph3aQ3UFY4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rsph3aQ3UFY4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph3aQ3UFY4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms