Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zyg11bQ3UFS0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zyg11bQ3UFS0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zyg11bQ3UFS0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zyg11bQ3UFS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zyg11bQ3UFS0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zyg11bQ3UFS0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zyg11bQ3UFS0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zyg11bQ3UFS0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zyg11bQ3UFS0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zyg11bQ3UFS0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms