Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil3Q3UFQ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil3Q3UFQ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil3Q3UFQ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Carmil3Q3UFQ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carmil3Q3UFQ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms