Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Trip13Q3UA06 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trip13Q3UA06 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms