Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbrQ3U9G9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LbrQ3U9G9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LbrQ3U9G9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms