Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U7U4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U7U4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U7U4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U7U4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U7U4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U7U4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U7U4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3U7U4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U7U4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U7U4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3U7U4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3U7U4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U7U4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms