Protein–RNA interactions for Protein: Q3U492

Kcp, Kielin/chordin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KcpQ3U492 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KcpQ3U492 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KcpQ3U492 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KcpQ3U492 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KcpQ3U492 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms