Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1Y4

Dennd4b, DENN domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd4bQ3U1Y4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Dennd4bQ3U1Y4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Dennd4bQ3U1Y4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Dennd4bQ3U1Y4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Dennd4bQ3U1Y4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Dennd4bQ3U1Y4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Dennd4bQ3U1Y4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Dennd4bQ3U1Y4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Dennd4bQ3U1Y4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Dennd4bQ3U1Y4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dennd4bQ3U1Y4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dennd4bQ3U1Y4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Dennd4bQ3U1Y4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms