Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hace1Q3U0D9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Hace1Q3U0D9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms