Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a5Q3TYU2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp13a5Q3TYU2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms