Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pbxip1Q3TVI8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbxip1Q3TVI8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pbxip1Q3TVI8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pbxip1Q3TVI8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms