Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ccdc136Q3TVA9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc136Q3TVA9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Ccdc136Q3TVA9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ccdc136Q3TVA9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ccdc136Q3TVA9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms