Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21440Q3TTD8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms