Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Calr4Q3TQS0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calr4Q3TQS0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Calr4Q3TQS0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Calr4Q3TQS0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Calr4Q3TQS0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms