Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms