Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf3c3Q3TMP1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms