Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc10Q3TLI0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc10Q3TLI0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc10Q3TLI0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms