Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlrp4cQ3TKR3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4cQ3TKR3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms