Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hs1bp3Q3TC93 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hs1bp3Q3TC93 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Hs1bp3Q3TC93 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hs1bp3Q3TC93 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms