Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Trpm1Q2TV84 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trpm1Q2TV84 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Trpm1Q2TV84 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Trpm1Q2TV84 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trpm1Q2TV84 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms