Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q149G0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q149G0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q149G0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q149G0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q149G0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q149G0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q149G0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q149G0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q149G0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q149G0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q149G0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q149G0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q149G0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q149G0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q149G0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q149G0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q149G0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q149G0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q149G0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q149G0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q149G0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q149G0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q149G0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q149G0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q149G0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q149G0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q149G0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q149G0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q149G0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q149G0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q149G0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q149G0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q149G0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q149G0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q149G0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q149G0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q149G0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q149G0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q149G0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q149G0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q149G0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q149G0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q149G0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q149G0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q149G0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q149G0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q149G0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q149G0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q149G0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q149G0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q149G0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q149G0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q149G0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q149G0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q149G0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q149G0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q149G0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q149G0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q149G0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q149G0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q149G0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q149G0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q149G0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q149G0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q149G0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q149G0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q149G0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q149G0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q149G0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q149G0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q149G0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q149G0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q149G0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q149G0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q149G0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q149G0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q149G0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q149G0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q149G0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q149G0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q149G0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q149G0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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