Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc39dQ0VF76 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc39dQ0VF76 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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