Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15,27■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,27■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15,27■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,27■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15,27■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,27■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,27■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15,27■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,24■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,24■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,24■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,24■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15,24■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,24■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,23■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15,23■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,23■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,23■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15,23■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,23■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15,23■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,23■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15,22■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15,22■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,22■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,21■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15,21■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,21■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,21■□□□□ 0,03
Pglyrp4Q0VB07 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,21■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,21■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,21■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,2■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15,19■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15,19■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,18■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,18■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,17■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,17■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
Pglyrp4Q0VB07 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,13■□□□□ 0,01
Pglyrp4Q0VB07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms