Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rab42Q0PD08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab42Q0PD08 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab42Q0PD08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms