Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kndc1Q0KK55 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kndc1Q0KK55 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kndc1Q0KK55 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kndc1Q0KK55 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms