Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp2Q06649 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp2Q06649 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp2Q06649 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms