Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cab39Q06138 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cab39Q06138 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms