Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hspg2Q05793 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.1 ms