Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcad1Q04692 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcad1Q04692 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms