Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CkbQ04447 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CkbQ04447 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CkbQ04447 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkbQ04447 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkbQ04447 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CkbQ04447 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkbQ04447 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkbQ04447 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkbQ04447 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CkbQ04447 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CkbQ04447 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CkbQ04447 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkbQ04447 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms