Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl7Q03366 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccl7Q03366 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.7 ms