Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk7Q03147 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk7Q03147 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms