Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax5Q02650 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms