Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde1bQ01065 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde1bQ01065 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde1bQ01065 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pde1bQ01065 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms