Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpina1cQ00896 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpina1cQ00896 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpina1cQ00896 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms