Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmmrQ00547 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HmmrQ00547 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmmrQ00547 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmmrQ00547 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms