Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax8Q00288 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pax8Q00288 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms