Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp11aP98197 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp11aP98197 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp11aP98197 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp11aP98197 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp11aP98197 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp11aP98197 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp11aP98197 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp11aP98197 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp11aP98197 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp11aP98197 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms