Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd1P97443 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smyd1P97443 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smyd1P97443 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd1P97443 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms