Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim43bP86448 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim43bP86448 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms