Protein–RNA interactions for Protein: P86050

Tmem170b, Transmembrane protein 170B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem170bP86050 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem170bP86050 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem170bP86050 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem170bP86050 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152 ms