Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TgfbiP82198 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TgfbiP82198 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TgfbiP82198 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms