Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Q6P79568 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Q6P79568 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Q6P79568 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms