Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sparcl1P70663 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sparcl1P70663 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms