Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tp53bp1P70399 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tp53bp1P70399 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms